Государственный деятель, ученый-историк, профессор, организатор и первый ректор Алматинского медицинского института (ныне Казахский национальный медицинский университет имени С. Асфендиярова).
Родился в Ташкенте. Окончил ташкентское реальное училище, Петербургскую военно-медицинскую академию в 1917 году, где он учился на стипендию военно-морского министерства. Это обстоятельство обязывало его выносить в дальнейшем все тяготы военной службы. Как участник Первой мировой войны вначале он был в Термезе, а потом, во время военных действий, служил военным врачом Туркестанского полка, возле города Лодзи попал в германский плен, в результате обмена военнопленными он вернулся в 1916 году через Швецию.
После Февральской революции, в 1917–1919 годах, С. Асфендияров участвовал в работе Советов — был членом Бухарского, Ташкентского совдепов, Туркестанского краевого совета, военврачом и членом мусульманского бюро Черняевского полка, членом Старгородского Ташкентского совета мусульманских депутатов. Участвовал в военных действиях на Каспийском побережье.
В 1919–1920 годы С. Асфендияров – народный комиссар здравоохранения, нарком земельно-водного хозяйства Туркестанской АССР.
Деятельность С. Асфендиярова всегда была связана с социально-экономическими и культурными изменениями в Казахстане и Средней Азии. Будучи руководящим работником, он хорошо знал особенности быта, вопросы истории и культуры восточных народов. В соответствии с этим С. Асфендияров был представителем Туркестанской Республики в Москве с 1921 до 1922 года и одновременно был членом коллегии Совнаркома РСФСР по национальным вопросам, где его, как опытного агрария, включили в состав специальной комиссии ВЦИК по разделу земли.
В 1922 году С. Асфендияров как делегат Х Всероссийского съезда Советов поддержал решение об образовании СССР.
В 1923–1925 годах он – заведующий отделом водного хозяйства Наркомата земледелия ТАССР, ответственный секретарь ЦК Компартии Туркестана, член Среднеазиатского бюро ЦК ВКП (б), заместитель секретаря и член Президиума ВЦИК.
В период работы в Москве обнаружилась еще одна грань таланта С. Асфендиярова, его активные научные поиски в области истории определили творческое будущее ученого. С самых первых дней пребывания в Москве он сотрудничал с Институтом востоковедения при ЦИК СССР, преподавал в МГУ. В эти годы С. Асфендияров часто встречался с представителями зарубежного Востока. Свидетельством научных заслуг является назначение его в 1927–1928 годах ректор Московского института востоковедения имени Н. Нариманова и присвоение ему звания профессора Московского государственного университета.
Самые плодотворные годы жизни и деятельности ученого — это период с 1928 до 1937 года в Казахстане. В это время С. Асфендияров приложил много усилий к организации науки и первых учебных заведений в республике.
С 1928 по 1931 год С. Асфендияров — первый ректор и заведующий кафедрой истории Казахского педагогического института.
В 1931–1933 годы – народный комиссар здравоохранения КАССР – ректор Алматинского медицинского института, который сегодня носит его имя.
В 1933–1934 годы – заместитель наркома просвещения КАССР – начальник управления университетов, науки и библиотек.
В 1934–1937 годы – заведующий историко-археографической комиссией Казахского филиала Академии наук СССР, заместитель председателя Казахского филиала Академии наук СССР, заведующий отделом истории Научно-исследовательского института национальной культуры при КазЦИК, профессор кафедры истории Казахского педагогического института.
Знание русского, английского, французского и арабских языков дало ему возможность, пользуясь российскими и иностранными литературными первоисточниками, выполнить анализ обширного исторического материала и подготовить ряд научных работ. Он также занимался вопросами образования и научно-исследовательской работой в области истории. Анализ научных работ, написанных в последний период жизни, особенно ярко свидетельствует, что С. Асфендияров имел обширные знания, владел историческими методами исследования. В эти годы им были опубликованы обобщающие труды «История Казахстана с древнейших времен», «Прошлое Казахстана в источниках и материалах», монография «Национально-освободительное восстание 1916 года в Казахстане». Его перу принадлежат книги «Очерки истории казахов», «Шатер мира».
Государственный и общественный деятель, организатор науки и педагог, С. Асфендияров в 1937 году был незаконно репрессирован. Учитывая значительный вклад С. Асфендиярова в государственную, научную и общественную деятельность и в развитие просвещения и здравоохранения в Республике Казахстан, Совет Министров Казахской ССР 11 января 1989 года принял Постановление о присвоении его имени Алматинскому государственному медицинскому институту. Память о нем в Алматы увековечена названием улицы; на здании по улице Толе би, 29, где жил ученый, установлена мемориальная доска.